随着对建筑的深入探索，联合小队在一座巨大的金字塔形建筑中发现了一块古老的石板。石板上刻满了符文，这些符文与他们在遗迹行星水晶柱上看到的符文有着相似之处，但更加复杂。
科研人员和神秘守护者们通力合作，开始解读石板上的符文。经过一番艰苦的努力，他们逐渐明白了符文的含义。原来，古老文明在封印黑暗力量时，也预见到了可能出现的各种情况，并留下了应对之策。
此次起源星系的能量变化，是因为封印的修复触发了一系列的连锁反应，唤醒了古老文明设置的后备机制。这些机制旨在引导宇宙能量走向一种新的平衡，而联合小队的出现并非偶然，他们被视为实现这一平衡的关键因素。
然而，要实现这种新的平衡，联合小队需要在起源星系的不同星球上寻找五颗神秘的宝石。这些宝石分别蕴含着不同的能量属性，只有将它们集齐并放置在特定的位置，才能完成宇宙能量的重新调整。
就在联合小队准备踏上寻找神秘宝石的征程时，他们突然察觉到一股强大的力量正在靠近。通过飞船的探测系统，他们发现一支陌生的舰队正朝着他们所在的星球飞速驶来。这支舰队的能量信号强大而神秘，他们的来意究竟是什么？联合小队能否在这支舰队的干扰下，顺利找到五颗神秘宝石，实现宇宙能量的新平衡？新的挑战又一次摆在了联合小队的面前。