广州城在十余天的屠杀后，几乎成了一座空城，家家户户都被屠戮，外国传教士建造的教堂，也成了清军重点劫掠攻击的目标，卫匡国本人也遭到了清军的洗劫，差点命丧清军之手，最后是尚可喜亲自下令，才保住了他的性命，而广州的百姓却没有这么幸运，城市的每一个角落都充斥着尸体和鲜血，尸体无人掩埋，随处可见。
这场屠杀影响深远，七年后荷兰使臣纽霍夫路过广州，还记载了当地百姓对这场屠杀的心有余悸，估计屠杀中的死难者不少于八万人，这与卫匡国的记载不谋而合，而广州市志则记载，死难百姓军民，可能超过七十余万。
时至今日，这场大屠杀的阴影已经渐渐消散，广州城逐渐恢复了往日的繁荣，海外的船只填满了港口，如今还没有后世的一口通商和十三行，广州海贸的利益，全数掌握在当年那场屠杀的侩子手手中。
广州城内有一座大佛寺，始建于南汉时期，明末广州大屠杀时，这些有产有财的寺庙自然也成了清军重点劫掠攻击的地方，大佛寺被焚毁殆尽，直到康熙二年，尚可喜坐稳了这“广东王”的宝座之后，才将这座大佛寺重新修建起来。
越是罪孽深重的，越是