解决了北方的问题，就要解决南方的食盐盐区问题了，而对于南方来说，最重要的就是两淮盐运司的盐区了，作为大明最大的盐运司，也是盐税收入最多的盐运司，不光是朱载坖，整个朝廷也是极为重要的，朱载坖说道：“天下六运司，惟两淮运司为雄，治莅三分司，惟泰州分司为最，而安丰又泰州之巨场也。商灶渊薮，盐利甲东南之富。我国家国用所需、边饷所赖，半出于兹。岂可不重？”
对于两淮运司的重要性，朱载坖是很清楚的，对于整个南方的食盐供应来说，两淮食盐的重要性是可想而知的，不仅仅是关乎到百姓的生计，更直接关乎到朝廷的盐课，所以不管是朱载坖还是部院重臣，都是极为谨慎的。
两淮运司的行盐地域也是最广的，从南直到江西、湖广，但是正是由于行盐地域的广大，导致两淮运司和多个运司在行盐地域上有着严重的冲突，各方官员们经常为此扯皮，搞得朱载坖极为烦躁，所以朱载坖这次准备将各运司的行盐地域重新予以划分，免得他们为了此事在不断的扯皮。
两淮运司在江西和广东运司因为行盐的问题，有淮粤之争，广盐和淮盐在这里形成竞争关系，按照之前的行盐地域划分，江西是淮盐的行盐区，但是由于江西和广东距离较近，所以广盐越境的事情是很常见的，庞尚鹏就说道：“陛下，按旧制，广盐例不出省，今广东私盐由南路运过梅岭 ，贿赂所司纵放 ，直抵九江，江西该属不食淮盐者大半，此诚可虑者！”
对于广盐的越境私贩，侵夺淮盐市场，申时行等人的态度是极为坚决的，就是要严厉打击，维护淮盐在江西的地位，同时坚持广盐例不出省的旧例，将广盐限制在广东广西境内，不能使其威胁到淮盐的地位。
但是朱载坖显然不是这么看的，广盐能够侵夺淮盐的市场，说明什么？首先就是说明广盐的产量已经有所提升，除了满足两广需要之外，还可以向外出售，其次就是说明至少在江西，广盐比之淮盐，要更有市场竞争力，否则的话，广盐不可能在朝廷的行盐制度下，将淮盐驱逐出江西的市场，这是朝廷必须要考虑的事情。
两淮运司的利益自然是要保证的，但是朱载坖也不能盲目维护两淮运司的利益，朱载坖于是问道：“少司农怎么看此事？”